Biotechniques – Publikasi open access yang tidak melupakan mutu

Bagi kawan-kawan yang ingin mempelajari atau mengembangkan wawasan di bidang teknik-teknik biologi molekuler, genetika, dan genomik, majalah Biotechniques mungkin bisa jadi salah satu sumber bacaan. Majalah ini dapat diakses melalui http://www.biotechniques.com/ dan merupakan majalah dengan status “free subscription” atau bebas berlangganan. Artikelnya pun dapat diunduh gratis dengan format PDF (Portable data format) sehingga sangat nyaman untuk dibaca offline atau dicetak.

Majalah yang telah diterbitkan sejak 1983 ini merupakan salah satu publikasi yang mendukung konsep open access publishing dan memiliki impact factor yang lumayan tinggi (2.669 pada tahun 2012). Merupakan majalah yang termasuk dalam largest BPA-audited life science circulation dengan sekitar 80,000 orang dari lebih dari 111 negara telah mendaftarkan diri sebagai pelanggan tetap majalah ini . Bahkan, situs resmi majalah ini, http://www.biotechniques.com/ merupakan satu-satunya website life science yang telah disertifikasi oleh BPA.

Selamat Mencoba!!

Scitable – Sebuah Learning Space Untuk Mempelajari Sains

Scitable merupakan sebuah situs bebas bayar tempat berkumpulnya para ahli biologi ternama khususnya yang berhubungan dengan bidang genetika dan biologi sel & molekuler. Situs ini dikelola oleh Nature Education, sebuah divisi publik dari Nature Publishing Group (NPG).

NPG (http://www.nature.com/), yang terkenal lewat Nature Magazine–nya, merupakan satu dari beberapa penerbit majalah bermutu yang diakui oleh dunia. Sampai 2010, nilai impact factor Nature Magazine adalah sebesar 36.101. Bila dibandingkan dengan beberapa jurnal ternama seperti BioMed Central (BMC) Microbiology (2.96), Molecular Microbiology (4.819), dan Journal of American Medical Association (JAMA) (28.899), nilai ini cukup fantastis. Pembahasan tentang impact factor sebuah jurnal atau publikasi dapat dilihat di http://en.wikipedia.org/wiki/Impact_factor.

Scitable (http://www.nature.com/scitable) memiliki lima topik utama (sebentar lagi akan menjadi enam); Essential of Genetics, Essential of Cell biology, Cell Biology for Seminars, English Communication for Scientist, dan Guide to Life Science Careers. Semua topik bebas untuk diakses dan puluhan artikel siap untuk didiskusikan. Agar bisa berdiskusi dengan para pakar ternama di bidangnya masing-masing, ada baiknya bila anda mendaftarkan diri (register) terlebih dahulu.

Selamat Mencoba!!

Image credit: Scitable by Nature education

  

Important Links

Beberapa link yang saya rasa akan banyak membantu dalam mempelajari mikrobiologi-imunologi.

Microbiology-Immunology Online

http://pathmicro.med.sc.edu/book/welcome.htm

Situs ini sebenarnya dibuat oleh Department of Pathology, Microbiology and Immunology at the University of South Carolina School of Medicine untuk mengakomodir kebutuhan mahasiswa kedokteran tingkat dua (setara dengan semester 3 dan 4) di departemen tersebut. Situs ini bersifat non komersil dan dapat diakses dalam enam bahasa, English, Spanish, Portuguese, Albanian, Farsi, dan terakhir Arabic. Walaupun beberapa file tidak dapat diakses secara bebas (password-protected) namun secara umum, situs ini sangat berguna untuk mempelajari bakteriologi, mikologi, parasitologi, virologi, imunologi, dan penyakit infeksi. Situs ini juga dilengkapi dengan video lectures, glossary dan kuis di setiap bidangnya.

Multi Sequence Alignment Analysis

http://www.nrbsc.org/gfx/genedoc/

GeneDoc adalah sebuah program Multiple Sequence Alignment Editor yang dibuat oleh Karl Nicholas dan dikembangkan oleh Hugh Nicholas, seorang pakar bioinformatika dari The National Resource for Biomedical Supercomputing (NRBSC) (dahulu disebut Pittsburgh Supercomputing Centre, PSC). Program ini dapat digunakan secara gratis (freeware) namun sayangnya hanya mendukung Windows-based PC dan terakhir di-update awal Maret 2007 (versi 2.7.0). Tapi, di luar dari itu, GeneDoc secara garis besar merupakan program kecil dengan kekuatan besar dan saya rasa sangat berguna dalam penelitian berbasis biologi molekuler, utamanya dalam analisis sekuens DNA dan/atau RNA.

Phylogenetic Analysis

http://www.megasoftware.net/index.php

Molecular Evolution Genetic Analysis, atau yang biasa disingkat dengan MEGA, adalah sebuah program bioinformatika yang dapat dipergunakan dalam multi sequence alignment dan analisis filogenetik (hubungan kekerabatan). Saat ini, versi terbaru MEGA adalah v.5.0 dan mendukung tiga platform utama desktop PC di dunia, yaitu Windows-, Mac-, dan Linux-based computer systems. program ini cukup banyak diminati oleh para peneliti di tingkat internasional sebab dapat didownload secara gratis dan terus di-update (diperbaharui) oleh para pembuatnya (update terakhir 26 April 2011).

Nucleic Acids & Protein Sequence Database

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

National Center for Biotechnology Information (NCBI) merupakan salah satu website yang cukup sulit dideskripsikan. Ini disebabkan oleh banyaknya fitur yang terdapat di dalamnya dan ke-kompleks-an fungsinya. Situs ini dapat digunakan mulai dari membaca buku secara online sampai dengan mengakses database DNA, RNA, dan protein. Situs yang dikelola oleh U.S National Library of Medicine ini, memiliki segudang resources yang mungkin tidak akan habis dijelajahi dalam waktu sebulan penuh. Salah satu fiturnya, Nucleotide BLAST, diklaim sebagai salah satu database terbesar yang memuat sekuens asam nukleat makhluk hidup.

DNA Barcoding

http://www.boldsystems.org/views/login.php

Merupakan website yang dirancang untuk meningkatkan kemampuan peneliti dalam mengidentifikasi spesies baru dan/atau memperbaharui taksonomi spesies yang sudah ada melalui analisis genomik bagian gen yang sudah distandardisasi. Salah satu contohnya adalah penggunaan cytochrome oxidase subunit I (COI) gene dalam mitochondrial DNA sebagai DNA marker biologis dalam mengidentifikasi spesies makhluk hidup.

Molecular Biology Freeware

http://molbiol-tools.ca/molecular_biology_freeware.htm

Berisi daftar program-program yang dapat digunakan dalam penelitian berbasis molekuler.